pcr由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成：
1、模板dna的變性：模板dna經加熱至94℃左右一定時間后，使模板dna雙鏈或經pcr擴增形成的雙鏈dna解離，使之成為單鏈，以便它與引物結合，為下輪反應做準備；
2、模板dna與引物的退火(復性)：模板dna經加熱變性成單鏈后，溫度降至55℃左右，引物與模板dna單鏈的互補序列配對結合；
3、引物的延伸：dna模板--引物結合物在taq酶的作用下，以dntp為反應原料，靶序列為模板，按堿基配對與半保留復制原理，合成一條新的與模板dna 鏈互補的半保留復制鏈。
重復循環(huán)變性--退火--延伸三過程，就可獲得更多的“半保留復制鏈，而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2～4分鐘， 2～3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。