對公安機關的鑒定意見有異議的處理方式就是由當事人在規(guī)定期限內(nèi)向上一級機關部門提出異議申請并重新進行鑒定。公安機關的鑒定意見是可以作為法院定案的證據(jù)的，其屬于法律規(guī)定的證據(jù)類別當中。
一、對公安機關的鑒定意見有異議 如何處理
對公安機關的鑒定意見有異議的處理辦法是當事人可以對鑒定結論提出異議并重新申請鑒定。
根據(jù)《全國人民代表大會常務委員會關于司法鑒定管理問題的決定》第十一條規(guī)定，在訴訟中，當事人對鑒定意見有異議的，經(jīng)人民法院依法通知，鑒定人應當出庭作證。鑒定人和鑒定機構應當在鑒定人和鑒定機構名冊注明的業(yè)務范圍內(nèi)從事司法鑒定業(yè)務。鑒定人應當依照訴訟法律規(guī)定實行回避。
二、公安機關的鑒定意見能否作為法院定案的證據(jù)
公安機關的鑒定意見是可以作為作為法院定案的證據(jù)。
《刑事訴訟法》第五十條規(guī)定，可以用于證明案件事實的材料，都是證據(jù)。證據(jù)包括：
（一）物證；
（二）書證；
（三）證人證言；
（四）被害人陳述；
（五）犯罪嫌疑人、被告人供述和辯解；
（六）鑒定意見；
（七）勘驗、檢查、辨認、偵查實驗等筆錄；
（八）視聽資料、電子數(shù)據(jù)。證據(jù)必須經(jīng)過查證屬實，才能作為定案的根據(jù)。
三、司法鑒定意見不能作為證據(jù)使用的情形有哪些
《關于辦理死刑案件審查判斷證據(jù)若干問題的規(guī)定》第二十四條規(guī)定，鑒定意見具有下列情形之一的，不能作為定案的根據(jù)：
（一）鑒定機構不具備法定的資格和條件，或者鑒定事項超出本鑒定機構項目范圍或者鑒定能力的；
（二）鑒定人不具備法定的資格和條件、鑒定人不具有相關專業(yè)技術或者職稱、鑒定人違反回避規(guī)定的；
（三）鑒定程序、方法有錯誤的；
（四）鑒定意見與證明對象沒有關聯(lián)的；
（五）鑒定對象與送檢材料、樣本不一致的；
（六）送檢材料、樣本來源不明或者確實被污染且不具備鑒定條件的；
（七）違反有關鑒定特定標準的；
（八）鑒定文書缺少簽名、蓋章的；
（九）其他違反有關規(guī)定的情形。