一、結(jié)算金額超出合同部分該如何處理
當(dāng)事人在建設(shè)工程施工合同專用條款或另行簽訂的協(xié)議中明確約定發(fā)包人應(yīng)在收到承包人提交竣工結(jié)算文件后一定期限內(nèi)予以答復(fù)，且逾期未答復(fù)則視為認(rèn)可竣工結(jié)算文件的，承包人依據(jù)《最高人民法院關(guān)于審理建設(shè)工程施工合同糾紛案件適用法律問(wèn)題的解釋》第二十條的規(guī)定請(qǐng)求按照竣工結(jié)算文件結(jié)算工程價(jià)款的，應(yīng)予支持；沒(méi)有明確約定逾期未答復(fù)則視為認(rèn)可竣工結(jié)算文件的，承包人請(qǐng)求按照竣工結(jié)算文件確定工程價(jià)款的，不予支持。
因設(shè)計(jì)變更導(dǎo)致建設(shè)工程的工程量或者質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)發(fā)生變化，當(dāng)事人對(duì)該部分工程價(jià)款不能協(xié)商一致的，可以參照簽訂建設(shè)工程施工合同時(shí)當(dāng)?shù)亟ㄔO(shè)行政主管部門發(fā)布的計(jì)價(jià)方法或者計(jì)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)結(jié)算工程價(jià)款。
當(dāng)事人就同一建設(shè)工程另行訂立的建設(shè)工程施工合同與經(jīng)過(guò)備案的中標(biāo)合同實(shí)質(zhì)性內(nèi)容不一致的，應(yīng)當(dāng)以備案的中標(biāo)合同作為結(jié)算工程價(jià)款的根據(jù)。
《最高人民法院關(guān)于審理建設(shè)工程施工合同糾紛案件適用法律問(wèn)題的解釋》第十六條 當(dāng)事人對(duì)建設(shè)工程的計(jì)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)或者計(jì)價(jià)方法有約定的，按照約定結(jié)算工程價(jià)款。
因設(shè)計(jì)變更導(dǎo)致建設(shè)工程的工程量或者質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)發(fā)生變化，當(dāng)事人對(duì)該部分工程價(jià)款不能協(xié)商一致的，可以參照簽訂建設(shè)工程施工合同時(shí)當(dāng)?shù)亟ㄔO(shè)行政主管部門發(fā)布的計(jì)價(jià)方法或者計(jì)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)結(jié)算工程價(jià)款。
建設(shè)工程施工合同有效，但建設(shè)工程經(jīng)竣工驗(yàn)收不合格的，工程價(jià)款結(jié)算參照本解釋第三條規(guī)定處理。
第二十一條 當(dāng)事人就同一建設(shè)工程另行訂立的建設(shè)工程施工合同與經(jīng)過(guò)備案的中標(biāo)合同實(shí)質(zhì)性內(nèi)容不一致的，應(yīng)當(dāng)以備案的中標(biāo)合同作為結(jié)算工程價(jià)款的根據(jù)。
第二十二條 當(dāng)事人約定按照固定價(jià)結(jié)算工程價(jià)款，一方當(dāng)事人請(qǐng)求對(duì)建設(shè)工程造價(jià)進(jìn)行鑒定的，不予支持。
二、工程款追討需要哪些證據(jù)
追討工程款需要準(zhǔn)備以下證據(jù)：
1.施工單位資質(zhì)證書;
2.工程招投標(biāo)文件;
3.工程報(bào)建、規(guī)劃、國(guó)土、施工許可文件;
4.建筑安裝工程承包合同書及其補(bǔ)充協(xié)議;
5.施工圖紙;
6.不可抗力證明文件及損失證明;
7.工程進(jìn)度情況、工程施工日志;
8.工程量增減的簽證;
9.設(shè)計(jì)變更的文件;
10.質(zhì)量驗(yàn)收的證明;
11.工程進(jìn)度付款憑據(jù);
12.工程分包情況;
13.工程總決算書或分階段結(jié)算書等;
上述的證據(jù)都是在訴訟前就已經(jīng)形成的，所以在施工過(guò)程中，要注意這些證據(jù)材料的搜集、管理。
三、如何確定工程糾紛有管轄權(quán)的法院
建筑工程產(chǎn)生糾紛的，按以下情形確定法院管轄權(quán)：
1.如果是合同糾紛，合同有約定的，由約定地法院管轄，如果沒(méi)有約定的，由合同履行地或者被告人所在地法院管轄;
2.如果因建筑工程產(chǎn)生的不動(dòng)產(chǎn)糾紛，由建筑工程所在地法院管轄。
《中華人民共和國(guó)民事訴訟法》第二十四條 因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。
第三十四條 下列案件，由本條規(guī)定的人民法院專屬管轄：
（一）因不動(dòng)產(chǎn)糾紛提起的訴訟，由不動(dòng)產(chǎn)所在地人民法院管轄；
（二）因港口作業(yè)中發(fā)生糾紛提起的訴訟，由港口所在地人民法院管轄；
（三）因繼承遺產(chǎn)糾紛提起的訴訟，由被繼承人死亡時(shí)住所地或者主要遺產(chǎn)所在地人民法院管轄。