多菌靈能防治多種花卉的真菌性葉部病害和莖腐病、根腐病。使用方法也多種多樣。
(1)種子或種苗處理 防治百日草黑斑病用50％可濕性粉劑1 000倍液浸種5～10分鐘。防治唐菖蒲枯萎病，用50％可濕性粉劑500倍液浸球莖30分鐘再種植。防治馬蹄蓮葉霉病，用50％可濕性粉劑250倍液浸種30分鐘。防治仙人掌炭疽病，在莖節(jié)繁殖前，用50％可濕性粉劑浸莖節(jié)5～10分鐘。
(2)土壤消毒 一般是每平方米用50％可濕性粉劑6～8克，配成毒土，用1／3毒土墊播種溝(穴)，2／3毒土蓋籽?？煞乐味喾N花卉幼苗猝倒病、立枯病、白絹病以及仙人掌類炭疽病、令箭荷花黑霉病、曇花黑霉病、四季海棠莖腐病等。
(3)藻根及根際土壤一般用50％可濕性粉劑400～500倍液灌根或澆灌根際土壤，可防治多種花卉的根腐病、莖腐病、枯萎病以及雞冠花褐斑病、百合基腐病、水仙鱗莖基腐病等。
(4)噴霧一般用50％可濕性粉劑600～1000倍液，可防治多種花卉的白粉病、黑斑病及其他真菌性葉斑病等。