分子實驗之如何保證樣本核酸穩(wěn)定?

發(fā)布時間:2025-02-19
科研狗起早摸黑做了幾天分子克隆實驗,
本想著拖了好幾個星期的實驗終于要做完啦!瞬間覺得自己棒棒噠!
但是最后看實驗結果?。?!原地裂開
排查實驗試劑,沒問題!
排查實驗操作,沒問題!
排查儀器,沒問題!
那么問題到底出在哪呢?
其實問題有可能出現在樣本保存與前處理步驟中哦。生物樣本中的核酸(dna/rna)會因為核酸酶、溫度、ph值、微生物、自身化學性質等因素而發(fā)生被動或主動降解,從而導致分子實驗結果不盡人意。目前針對不同科研的需求,更多的樣本保存方式也相繼問世,小愛為大家匯總了各類樣本保存的步驟、注意事項、以及樣本保存耗材或保存液的推薦。
一、實驗樣本主要類型:
分子實驗中主要的樣本類型有:純核酸類、組織類、細胞類及環(huán)境類。不同樣本具有不同的保存方式以及操作注意事項。
圖1常見的實驗樣本類型
表1不同類型樣本核酸保存方法及穩(wěn)定性
類型
檢測目標
穩(wěn)定性及保存注意事項
組織
dna/rna
新鮮組織應盡快加入到含有核酸保護劑的管中,放置于冰上運輸至實驗室;石蠟包埋組織中的核酸在室溫即可保持穩(wěn)定。
血液
全血的dna/rna
dna:全血室溫可穩(wěn)定保存24h,2-8℃穩(wěn)定保存72h,-20℃可長期保存
rna:室溫不建議保存,樣本應至于含有核酸穩(wěn)定劑的管中,放置于冰上運輸至實驗室。
血清/血漿的cfdna/ctdna/病毒dna/病毒rna
cfdna:2-8℃,8h內分離血漿,-20℃或更低溫度穩(wěn)定保存;
ctdna:抽血后4-5h內即需要完成核酸提?。?br>病毒dna:2-8℃穩(wěn)定一周,-20℃穩(wěn)定一年以上;
病毒rna:2-8℃,6h內分離血漿,-20℃或更低溫度保存
干血片的dna
室溫穩(wěn)定保存19個月,需要注意防潮。
細胞
dna/rna
37℃保持細胞活力即可。
骨髓
rna
必須在采集后立即至于rna穩(wěn)定劑中,或者于液氮中速凍
胸水、腦水、腦脊液等其他生物體液樣本
dna
低溫(2-8℃)保存,盡快提取檢測。
二、實驗樣本前處理步驟及注意事項
1、組織樣本:
塊狀組織樣本短時間內無法充分裂解,一般需要進行樣本預處理。組織取材在組織離體30min內完成,取樣的動作要盡量快速利索,將組織按任一方向切成黃豆粒大小。
組織dna提?。盒迈r組織樣本用生理鹽水清洗2次,即刻進行實驗。如若不立即進行實驗,可用液氮速凍,-80℃凍存。
組織rna提?。簩游锘蛑参锝M織切成小塊,在液氮中磨碎或用勻漿器勻漿處理,快速轉入裝有1ml trizol(abs60154)的2ml離心管中,立即進行實驗。若后期再進行實驗,盡量保存時將樣本浸入rna樣品保存液(abs9268)后置4℃冰箱過夜(4℃過夜是必需的,這樣可使rna樣品保存液滲入到組織中),然后轉移到-20℃冰箱?;蛘咭旱心ソM織,加入trizol,放入-80℃保存。
圖2組織樣本rna提取流程圖
2、細胞樣本:
dna提取:細胞收集沉淀后,進行液氮速凍,-80℃保存。
rna提?。?br>1)貼壁細胞:吸盡培養(yǎng)液,每10cm2培養(yǎng)面積加入1ml trizol,用加樣器吹打數次,以確保細胞裂解,然后轉移至離心管中。注:貼壁細胞trizol的使用量應由培養(yǎng)皿表面積決定,而非由細胞數目決定。trizol量不足可能導致提取的rna中有dna污染;
2)懸浮細胞:離心收集細胞,吸盡液體,每5-10×106動植物或酵母細胞,或每1×107細菌細胞加入1ml trizol,用加樣器吹打,使其裂解,然后轉移至離心管中。 注:添加trizol前切勿洗滌細胞,以免rna降解。必要時可以用勻漿器來裂解某些細菌或者酵母細胞。若后期再進行rna提取實驗,細胞用液氮速凍,-80℃凍存。
3、血液樣本:
采用含有抗凝劑的真空采血管保存即可。但采血管中的抗凝劑種類多樣,抗凝劑的種類也會直接影響后續(xù)檢測結果,面對這么多的采血管如何進行選擇?我們建議使用edta或枸櫞酸鈉抗凝管,不建議使用肝素抗凝管(因肝素在后面的核酸提取過程中很難去除,且肝素對pcr反應有很強的抑制作用,因此不建議使用肝素抗凝管)。采集完血液,顛倒混勻備用。另外冰凍血液溶解過程中會有破碎的細胞釋放rna酶,因此在冰凍前加入trizol,切勿直接凍存新鮮血液,保存好的血液應避免反復凍融。
4、血清/血漿樣本:
全血不加抗凝劑分離的上清是血清,加入抗凝劑分離的上清是血漿。取全血后,靜止1-2h,置于離心機3000rpm離心15min即可獲得血清或血漿。
三、樣本前處理利器—rna樣品保存液(abs9268)
rna樣品保存液是一種無毒的可直接使用的樣品儲存液,能使細胞內的rna與rna酶分離,防止樣本中rna表達譜發(fā)生變化。加入樣本保存液的樣本中rna在室溫可以保存7天,4℃可以保存4周,-20℃、-80℃標本可以長期保存。在rna樣品保存液中保存的標本,反復凍融至室溫20次不影響rna的質量。
操作步驟:
1)計算保存液用量:根據要保存的各樣本的體積,計算出所需rna樣品保存液用量;a:rna樣品保存液的用量應當是組織體積的10倍(100mg組織約用1ml rna樣品保存液);b:離心收集2×107細胞rna樣品保存液的用量是1ml;
2)分裝:將rna樣品保存液按需要量分裝入自備保存管中;
3)切片:快速將較大的組織切成厚度<0.5cm的任意片狀,較小的組織直接取下,立即浸入rna樣品保存液中;
4)保存:保存時先將樣本浸入rna樣品保存液后置4℃冰箱過夜,然后轉移到-20℃冰箱或繼續(xù)轉移至-80℃冰箱。
四、本期小愛產品推薦
貨號
產品名稱
規(guī)格
abs9268
rna樣品保存液
100ml
abs9474
組織保存液
100ml
abs60150
rna酶抑制劑
2000u
abs60154
trizol
100ml
abs9259
無酶無菌水(depc水)
500ml
absin特色產品線:
wb相關:ecl發(fā)光液、預染marker、預制膠;ihc相關:二抗試劑盒、組化筆;ip/coip試劑盒;激動劑/抑制劑;血清、bsa、蛋白酶k、ctb、ttx、cee;凋亡試劑盒;呼吸爆發(fā)試劑盒;elisa試劑盒;重組蛋白;抗體: 二抗、標簽抗體、對照抗體;定制服務(抗體/多肽/蛋白/標記/檢測)...
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