茶樹紫黃素脫環(huán)氧化酶基因的cdna克隆及其生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2023-11-01
根據(jù)genbank中已登錄的植物紫黃素脫環(huán)氧化酶(vde)基因序列,以其高度保守的氨基酸序列設(shè)計一對簡并引物,采用rt-pcr與3′/5′-race相結(jié)合的方法,從茶樹(camellia sinensi)中克隆出vde的全長cdna,長度為1632bp,分析表明,該序列的5′-端和3′-端的非編碼序列長度分別為61bp和140bp,開放閱讀框為1422bp,編碼473個氨基酸。其轉(zhuǎn)運肽長度為132個氨基酸。成熟蛋白的氨基酸序列與擬南芥,萵苣,菠菜及煙草的同源性分別為83.5%。82.7%,82.1%和83.6%。且有3個特殊的結(jié)構(gòu)域;半胱氨酸富集區(qū),脂肪結(jié)合蛋白特征區(qū)和由谷氨酸富集的高電荷區(qū),分析表明,茶樹vde具有熱穩(wěn)定性。完成機構(gòu):安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部茶葉生物技術(shù)重點開放實驗室,安徽合肥230036
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