進(jìn)口細(xì)胞株蛋白的作用以及相互作用分析

發(fā)布時間:2024-04-15
進(jìn)口細(xì)胞株蛋白(cytoglobin,cygb)是一種細(xì)胞內(nèi)抗氧化蛋白,是近發(fā)現(xiàn)的脊椎動物珠蛋白超家族中的一員,它具有保護(hù)細(xì)胞、抑制腫瘤細(xì)胞增長的功能。進(jìn)行酵母雙雜交文庫構(gòu)建,篩選出與cygb相互作用的蛋白,為進(jìn)一步研究cygb的功能機制奠定基礎(chǔ)。酵母雙雜交文庫構(gòu)建是篩庫的前提,可用于目的蛋白的互作蛋白大規(guī)模篩選分析蛋白質(zhì)間的相互作用,是現(xiàn)在分子生物學(xué)與生物化學(xué)常用的手段。
酵母雙雜交技術(shù)是一種具有很高靈敏度的研究蛋白質(zhì)之間關(guān)系的技術(shù),大的優(yōu)點就是不需要分離純化蛋白質(zhì),整個過程只是對核酸進(jìn)行操作,同時充分利用酵母生長速度快、易于操作等特點,酵母雙雜交文庫構(gòu)建一般包括核體系和膜體系兩種方法。美迪西提供酵母雙雜交服務(wù),具有獨立實驗室,專業(yè)實驗人員,提供詳細(xì)的酵母雙雜交實驗步驟、原始數(shù)據(jù)和圖片、結(jié)果分析,可以出具檢測數(shù)據(jù)報告。
進(jìn)口細(xì)胞株蛋白初由日本tawada等在2001年在大鼠纖維化肝臟的星狀細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了此種蛋白。由于其具有緊湊的螺旋形結(jié)構(gòu)和結(jié)合血紅素的能力,可可逆的結(jié)合各類氣體分子,如氧氣、一氧化氮等。cygb在缺氧時表達(dá)上調(diào)且特定地表達(dá)在毛細(xì)血管周圍,提示其可能具有氧感受器的作用。cybd可以作為清道夫,清除組織缺血后再灌注時產(chǎn)生的ros和no分子。此外它還具有過氧化氫酶活性,在肝星狀細(xì)胞中其過氧化物清除劑的作用。研究顯示,cygb對肝纖維化的逆轉(zhuǎn)有著非常顯著的作用。
cygb具有預(yù)防肝纖維化、實現(xiàn)肝纖維化逆轉(zhuǎn)的功能,且其作用是通過調(diào)控hsc的激活狀態(tài)實現(xiàn)的,與肝臟中細(xì)胞及細(xì)胞外基質(zhì)間的氧化應(yīng)激密切相關(guān)。有研究者選取了兩種肝臟中有代表性的氧化模型,過氧化氫模型及鐵過載模型,系統(tǒng)性研究了cygb在肝纖維化氧化應(yīng)激中發(fā)揮的具體作用,并結(jié)合microrna(mirna)技術(shù),初步探索了cygb在肝星狀細(xì)胞激活時表達(dá)上調(diào)的可能性機制。該研究為全面闡釋cygb這一治療基因的抗氧化作用及機制、加速藥物新靶點開發(fā)提供了理論依據(jù)。
有研究者通過酵母雙雜交篩選出17個與cygb相互作用的蛋白,環(huán)指蛋白2(rnf2)是其中之一,為進(jìn)一步研究cygb的功能機制奠定基礎(chǔ)。首先進(jìn)行酵母雙雜交文庫構(gòu)建,篩選mate&platetmlibrary-universalhuman(normalized)人源標(biāo)準(zhǔn)化cdna文庫,尋找與cygb相互作用的蛋白,然后研究者通過酵母回復(fù)性雜交實驗和免疫共沉淀實驗進(jìn)一步驗證cygb與rnf2之間的相互作用。
環(huán)指蛋白2(rnf2)屬于多梳家族,是多梳抑制復(fù)合物1(prc1)中的一員。rnf2可以介導(dǎo)組蛋白h2a的泛素化,因此rnf2在多梳結(jié)構(gòu)介導(dǎo)的基因抑制中發(fā)揮重要作用。rnf2作為prc1家族的一員,在胃癌、結(jié)腸癌、淋巴癌等多種癌癥中高表達(dá)。rnf2具有原癌基因的活性,敲除rnf2的hela細(xì)胞形態(tài)會發(fā)生改變,,細(xì)胞增殖也會受到抑制。rnf2是一種e3連接酶,與p53具有直接的相互作用,在人結(jié)腸癌hct116細(xì)胞系中它可以以p53為靶點通過蛋白酶體途徑,促進(jìn)p53的降解,從而影響p53下游基因的表達(dá)水平,以調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡。
據(jù)此研究者推測cygb與rnf2之間的相互作用很可能與腫瘤的發(fā)生發(fā)展具有一定的關(guān)聯(lián)性。該研究具有以下作用:
(1)成功構(gòu)建了pgbkt7-cygb重組表達(dá)載體,該重組質(zhì)粒在y2hgold酵母菌株成功表達(dá)bd-cygb-myc融合蛋白,且cygb誘餌蛋白對y2hgold酵母細(xì)胞無毒性作用、無自激活活性。實驗結(jié)果表明,pgbkt7-cygb酵母誘餌表達(dá)載體構(gòu)建成功,可以用于文庫篩選。
(2)以pgbkt7-cygb重組質(zhì)粒為誘餌從mate&platetmlibrary-universalhuman(normalized)文庫中篩選cygb的相互作用蛋白,終得到32個藍(lán)色的陽性克隆。陽性克隆質(zhì)粒的pcr產(chǎn)物經(jīng)測序鑒定、比對初步得到了17個細(xì)胞珠蛋白的相互作用基因。其中rnf2、slc7a13、atp1b1這三個基因重復(fù)出現(xiàn)多次。rnf2基因一共重復(fù)出現(xiàn)11次,并且與癌癥相關(guān),是研究者們驗證和深入研究的重點。
(3)經(jīng)酵母回復(fù)性雜交實驗證明在酵母中rnf2確實能與cygb發(fā)生相互作用。經(jīng)免疫共沉淀實驗證明rnf2和cygb在hek293t細(xì)胞中發(fā)生了相互作用。
(4)在人結(jié)腸癌hct116細(xì)胞中,cygb過表達(dá)可以提高rnf2的mrna水平,降低p53和p21的mrna水平。提示cygb很可能正向調(diào)控rnf2,從而影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展。
通過酵母雙雜交系統(tǒng)篩選出與進(jìn)口細(xì)胞株蛋白相互作用蛋白的研究,為進(jìn)一步加深對進(jìn)口細(xì)胞株蛋白生物學(xué)功能的認(rèn)識,和為治療肝纖維化等疾病提供堅實的理論基礎(chǔ)。
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