為滿足人們和市場對某些花卉的特殊性狀或花朵顏色的需要，進行慎重地設(shè)計和選擇有利的親本進行人工授粉是十分必要的。這一操作的目的，是為了阻止自花授粉，因此，必須在開花之前，用鑷子將花藥或整個雄蕊摘除。若在不同基因型的親本之間進行雜交，尚須在人工去雄之前先將鑷子浸入工業(yè)酒精中消毒，晾干后再使用，這樣才能保證雜交后代的混雜比率降到最低程度。
在一些豆科和菊科著名的品種中，它們的花絲往往與花柱的周圍連接，形成一個管狀體，因此，當我們對此進行去雄操作時，必須相當熟練和小心，否則就會損傷花的雌性部分。更有甚者是菜豆屬的一些品種，它們雌蕊的花柱被雄蕊鞘像彈簧一樣纏繞著，給人工去雄帶來更大的困難。另外，類似于萵苣屬的植物，它們的花很小，也難以進行人工去雄，更不便進行大量操作。近年來，國外又發(fā)明了一種便攜式小型電子振蕩器用于許多自花授粉植物{如蕃茄和三色紫羅等）的人工去雄和授粉上已獲成功。
人工去雄和授粉之后，必須進行套袋保護，以防花粉丟失和混交。除非特別需要，否則這些試驗材料必須種植在專用的溫室中。一般常用的雜交袋是用細紗布或精細的尼龍布以及玻璃紙制成的。一些開大花的植物，在進行人工去雄和授粉之后，可用一小塊金屬箔包在柱頭周圍。對風媒傳粉的植物來說，更要特別小心，因為它們的花粉極易被風吹跑。在這種情況下，使用的親本如能產(chǎn)生帶有遺傳標記的花粉是最理想的。因為它所調(diào)控表達的遺傳性狀是純合的，且在雜種后代中很容易識別出來。
收集花粉通常是在散粉之前進行，并放在溫和的容器中催熟。而后放在有通風設(shè)備的專用房間里干燥。有時也可以用抽吸的方法，從開放的花中將花粉收集到一個小的玻璃容器中，但這些收集方法卻不適于昆蟲傳粉的品種。另一種方法是收集未開裂的花藥，并將其晾干，經(jīng)摩擦后立即過篩，將花粉篩到一塊玻璃板上，經(jīng)12～24小時后，將未磨開的花藥用刀片切開，再次進行精細地過篩，使花粉充分分開。
進行人工授粉的辦法，通常是用一把駝毛毛刷將花粉授在柱頭上。此毛刷在使用前也須像鑷子一樣進行消毒。
雜交后要掛標簽注明親本和日期，并應注意標牌不易被動物移動和被風吹掉。