牡丹的繁殖方法有種子繁殖、分株繁殖、嫁接繁殖、壓條繁殖、扦插繁殖和組織培養(yǎng)等繁殖方法。具體選用何種繁殖方法，應根據(jù)生產(chǎn)目的和牡丹的生長習性，適時適地進行。
1、種子繁殖法適于單瓣或半重瓣品種，主要用于選育優(yōu)良新品種及培育砧木。
(1)采種時間及方法：因種子成熟有早有晚，要分批采收。在7月下旬至8月上旬，當角果呈蟹黃色時，就可以進行采收。采收后放在屋內(nèi)地面上，并經(jīng)常翻動，以防濕度過大發(fā)霉。采種過早不成熟，過晚種皮變黑發(fā)硬不易出苗。
(2)種子處理：可將種子放入水中浸泡60～100分鐘，取底部飽滿顆粒作為播種用種子。有些種子種皮干而發(fā)硬，可用溫水（50℃）浸種一晝夜，使種皮變軟，吸水膨脹后播種。有的種皮厚，可用濃硫酸浸種2分鐘或用95％酒精浸種30分鐘，然后取出用清水洗凈。
(3)整地：播種前要深翻土地，同時施足底肥。每畝可施人糞3500－5000kg或餅肥300～350kg。施肥后整成高畦，高8～15cm，寬40～60cm，間距25cm。整畦后如地較干燥，可從畦間灌水。
(4)播種時間及方法：8月下旬至9月上旬可進行播種。牡丹種子有上胚軸休眠的特性,當年播種后常溫下只發(fā)出幼根，第二年春才萌發(fā)出土?？蓪⒎N子按株距4～5cm，行距7～10cm點播，亦可撒播，但不宜過密。播后覆土1～2cm。每畝用種30kg左右。
(5)播后管理：如果天氣干旱，可將畦間灌水，讓水慢慢浸透。注意適時松土除草，結合澆水適當施肥，并注意防治病蟲害，及時人工捕捉害蟲或施藥。如管理得當，一年即可進行移栽。種子苗需4～5年方可開花。
2、分株繁殖法適用于所有品種，是應用最廣泛的一種繁殖方法。
(1)分株時間：牡丹分株與栽植時間以9月下旬至10月上旬為宜。我國有“春季栽牡丹，到老不開花”的說法，說明適時分植的重要性。如過早，因外界氣溫依然很高，促使秋發(fā)，冬季易受害，降低抗寒、抗旱能力；過晚，則根部傷口不易愈合，新根形成少，消耗大量養(yǎng)分，植株長勢不旺，遇旱易死亡。
(2)分株方法：將4～5年生的牡丹從土中挖出，去掉附土，可剪去部分大根及中等根，亦可不剪，小根全部保留，并剪去所有帶病黑根。置陰涼處晾曬2～3天，待根變軟后再用利刀從其自然可分處劈開，使每一新株保留適當根系和蘗芽。4年生植株可分3～4株，每株至少保留2～3個蘗芽。分劈后，傷口最好用硫磺粉或1％濃度的硫酸銅溶液消毒。
(3)栽植：在選好并整好的地里施足底肥，每畝可栽植1 000棵左右。栽植時，將根部自然疏展，邊填土，邊震動，使根與土密結并用棍搗實，深度以苗的根頸與地平或略低于地平面。栽后可將根頸上部老枝剪除或短剪。然后封土15cm左右，即可保證安全越冬。
3、嫁接繁殖法大量繁殖時較多采用，對一些發(fā)枝力弱的名貴品種較有意義，具有成本低、速度快的優(yōu)點。
(1)砧木選擇：砧木可選用牡丹根、牡丹實生苗或芍藥根。用牡丹根作砧木繁殖的植株，前期生長慢，萌蘗多，有利以后分株，壽命長，但牡丹根均較細，嫁接不方便，多不采用。多選用2～3年生、根莖粗壯的鳳丹實生苗作砧木，成活率高，移栽時不必剪砧木。芍藥根雖木質化弱，但操作方便，選粗2 cm以上、長15～20cm、須根較多的粗壯根，成活率均較高，但接穗基部發(fā)根少，萌蘗少，壽命短。在嫁接前2天，稍微晾曬變軟后即可進行嫁接。
(2)接穗選擇：接穗選生長健壯、無病蟲害的一年生粗壯萌蘗枝。接穗長8～10cm，帶有健壯的頂芽和側芽。接穗要隨剪隨接，不可存放過久。
(3)嫁接時間和方法：嫁接時問以9～10月間為宜，與牡丹、芍藥分株、移栽和采根作藥材同時進行。過早嫁接因溫度高，易“秋發(fā)”；過晚，生根少，長勢弱，成活率低。
方法：粗根多用嵌接法，細根則用劈接法。但不論采用哪種方法，都要使接穗與砧木皮部的形成層緊密結合。
①劈接法：將接穗下端削成對稱的楔形，長2～3cm，將陰軟好的砧木頂端削平，從中間用嫁接刀劈開，深度2～3cm。將削好的接穗從上而下插入砧木裂口里，使二者形成層對齊，然后用麻皮綁好，并用稀粘土將接口包住。接后即可栽植，深度以接口低于地面3～6cm為宜，并搗實下部土壤使砧木與土壤密結(注意不要傷接穗)。然后輕輕培土，成屋脊狀，以防寒越冬。
②枝接法：用2～3年生的牡丹實生苗作砧木。將實生苗從根頸處3 cm處剪去。其余方法同劈接法。接后，用稀粘土封嚴，培土，以防寒越冬、保墑。
③芽接法：以夏季7～8月間為好。首先在選好的芽上、下方各0.5 cm處橫切一刀，再在芽左右各豎切一刀，剝下腋芽。用同樣的方法去掉砧木上的腋芽，大小要相同，立即將接芽貼上，芽眼要對齊，隨后用麻皮綁好。挺接法、芽接法，都可以在一株上接上不同顏色的品種，提高觀賞效果，成為“什樣錦”。
(4)管理：次年春，要稍微松土，以利接穗萌芽出土。當花蕾長出1～2cm時，為避免消耗養(yǎng)分，要將花蕾摘除，并適時澆水、施肥，防治病蟲害。如管理得當，二年即可移栽。
4、扦插繁殖法時間以9月上旬至9月下旬為宜。選擇從大株牡丹根際萌發(fā)的l～3年生、無病蟲害、粗壯側芽多的枝條作為插穗。插穗長10～15cm，用300～500μg／g的吲哚乙酸速蘸處理后插入苗床，深度為插穗的1／2或1／3，插后踏實土壤，并澆透水，經(jīng)常保持土壤濕潤。
5、壓條繁殖法 該方法是利用生長在母樹上的枝條埋入土中或用其他濕潤的材料包裹，促使枝條的被壓部分生根，生根后與母株割離而成為獨立的新植株。該法簡便易行，對一些名貴稀有品種較為適用。有低壓和高壓兩種方法。
(1)低壓法：在秋季9～10月份，將2年生以上的枝條，從基部環(huán)剝，寬0.5－1cm，深達木質部，或刻傷深達枝條木質部，然后用濕土將整個枝條埋實壓牢，并經(jīng)常保持土壤濕潤。
(2)高壓法：亦叫空中壓條，適用于一些植株高大或獨干型的牡丹。在整個生長期均可進行，但以春末為好。環(huán)剝、刻傷方法同低壓法，將傷口用濕潤的、消過毒的純腐殖土包好，用塑料袋包裹。經(jīng)常觀察，保持濕潤。
6、組織培養(yǎng)法：植物組織培養(yǎng)，是指在無菌條件下，剝?nèi)≈仓瓴糠只畹闹参锝M織或器官，并給以適合其生長、發(fā)育的環(huán)境條件，使之分生出新植株的一種技術。牡丹可剝?nèi)∧垩俊⒛廴~及葉柄等部分來進行培養(yǎng)。目前，部分地、市如北京、上海、山東、洛陽等地已成功培育出生根試管苗，但因其繁殖量小，尚未投入大田生產(chǎn)。