1．選用優(yōu)質(zhì)的瓊脂糖：不同品牌的瓊脂糖在質(zhì)量上有較大的差異。劣質(zhì)瓊脂糖會(huì)導(dǎo)致dna條帶模糊，甚至條帶缺失。因此請(qǐng)盡量選擇質(zhì)量穩(wěn)定可靠的品牌。
2．選擇適當(dāng)?shù)哪z濃度：
瓊脂糖凝膠的線性dna分辨范圍
3．凝膠制備：配制凝膠和電泳應(yīng)選用相同的1x緩沖液；使用的容器體積至少是凝膠溶液的3倍，以免溶液沸騰時(shí)溢出；制膠過(guò)程中盡量趕除氣泡；根據(jù)樣品的濃度和體積選擇適當(dāng)大小的梳子。
4．選擇適當(dāng)?shù)碾娪揪彌_液：genstar® sd緩沖液（cat. no. e101-50）和tbe緩沖液適用于分離比較小的dna片段，tae緩沖液（cat. no. e102-50）適用于分離比較大的dna片段；緩沖液應(yīng)及時(shí)更新；膠回收純化應(yīng)使用新鮮配制的1x電泳緩沖液，以防核酸酶和dna雜帶污染。
5．核酸樣品的準(zhǔn)備：提取的dna樣品應(yīng)去除蛋白和多余的鹽分等雜質(zhì)；pcr樣品應(yīng)盡量在24小時(shí)內(nèi)電泳檢測(cè)，否則條帶容易模糊。
6．上樣緩沖液：所有泳道應(yīng)使用相同的上樣緩沖液，以防止因離子強(qiáng)度不同造成條帶遷移率偏差。
7．適量上樣：上樣過(guò)多會(huì)導(dǎo)致上樣孔超載，出現(xiàn)拖帶現(xiàn)象；上樣體積過(guò)小可能導(dǎo)致條帶亮度不均。
8．電壓及電泳時(shí)間：根據(jù)電泳槽型號(hào)、凝膠濃度、電泳緩沖液種類和目的條帶大小等選擇適當(dāng)?shù)碾妷汉碗娪緯r(shí)間。使用genstar®sd電泳緩沖液時(shí)，電壓設(shè)置為20~35 v/cm膠長(zhǎng)；使用tae或tbe緩沖液時(shí)，最大電壓以不超過(guò)20 v/cm膠長(zhǎng)為宜。