國際有機農(nóng)業(yè)和有機農(nóng)產(chǎn)品的法規(guī)與管理體系主要分為三個層次，一是聯(lián)合國層次，二是國際性非政府組織層次，三是國家層次。
聯(lián)合國層次的有機農(nóng)業(yè)和有機農(nóng)產(chǎn)品標準是由聯(lián)合國糧農(nóng)組織（fao）與世界衛(wèi)生組織（who）制定的，是“食品法典”的一部分，目前尚屬于建議性標準。我國作為聯(lián)合國成員國也參與了標準制定?！笆称贩ǖ洹弊鳛槁?lián)合國協(xié)調(diào)各個成員國食品衛(wèi)生和質(zhì)量標準的跨國性標準，一旦成為強制性標準，就可以作為wto仲裁國際食品生產(chǎn)和貿(mào)易糾紛的依據(jù)。“食品法典”的標準結(jié)構(gòu)、體系和內(nèi)容等基本上參考了歐盟有機農(nóng)業(yè)標準u2092/91以及國際有機農(nóng)業(yè)運動聯(lián)盟（ifoam）的“基本標準”。
國際有機農(nóng)業(yè)運動聯(lián)盟的基本標準屬于非政府組織制定的有機農(nóng)業(yè)標準，盡管它屬于非政府標準，但其影響卻非常大甚至超過國家標準。國際有機農(nóng)業(yè)運動聯(lián)盟成立于1972年，到目前已經(jīng)有110多個國家700多個會員組織。它的優(yōu)勢在于聯(lián)合國際上從事有機農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、加工和研究的各類組織和個人，其制定的標準具有廣泛的民主性和代表性，因此許多國家在制定有機農(nóng)業(yè)標準時參考ifoam的基本標準，甚至fao在制定標準時也專門邀請了ifoam參與制定。
國家層次的有機農(nóng)業(yè)標準以歐盟、美國和日本為代表，其中目前已經(jīng)制定完畢且生效的是歐盟的有機農(nóng)業(yè)條例eu2092/91及其修改條款。歐盟標準適用于其15個成員國的所有有機農(nóng)產(chǎn)品的生產(chǎn)、加工、貿(mào)易包括進口和出口。也就是說，所有進口到歐盟的有機農(nóng)產(chǎn)品的生產(chǎn)過程應該符合歐盟的有機農(nóng)業(yè)標準。因此，歐盟標準制定完成后，對世界其他國家的有機農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)、管理，特別是貿(mào)易產(chǎn)生了很大影響。
以歐盟標準為范本，美國和日本也加緊了標準制定。1990年，美國頒布了“有機農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)法案”，并成立了國際有機農(nóng)業(yè)標準委員會（nosb），由美國農(nóng)業(yè)部市場司歸口領導。美國的有機標準基本上與歐盟的類似，區(qū)別在于美國的標準把檢查、認證等完整地列入。美國有機農(nóng)業(yè)標準于2001年2月20日開始試行。2002年8月正式執(zhí)行。日本2000年4月份推出了有機農(nóng)業(yè)標準，具體內(nèi)容與歐盟95%以上是相似的。該標準于2001年4月正式執(zhí)行。