對剛出土的除蟲菊幼苗應(yīng)進行地面消毒工作，防止幼苗根基腐爛死亡，為此應(yīng)做好以下兩項措施：
一、若在播種時未進行土壤消毒，小苗出土后應(yīng)用多菌靈、唑菌威等殺菌劑進行消毒。幼苗要有充分光照，若用大棚育苗濕度不宜太大，棚內(nèi)氣溫達25度時應(yīng)適當放風，讓棚內(nèi)空氣流通。揮發(fā)棚內(nèi)空氣中水份，有利于幼苗健壯生長。
二、除蟲菊幼苗在未形成木質(zhì)化時，其自身還未開始產(chǎn)生菊酯，為此不具備殺蟲作用，若遭害蟲侵害，需進行農(nóng)藥殺蟲，最好選用菊酯類農(nóng)藥，用菊酯類農(nóng)藥不但起殺蟲作用，還可促進除蟲菊自身菊酯產(chǎn)生。
除蟲菊幼苗蟲害情況有兩種：一種夜螺蟲，當幼苗出土15天左右，夜間害蟲夜螺時常出來活動，從根部咬斷幼苗，此時可用呋喃丹在地上撒一層防止夜螺咬苗，一些老種戶在下種時，就在地面上撒一層早已備好的除蟲菊干粉，防治夜螺咬苗，效果極佳。其次幼苗期也可能遭受蚜蟲侵害，若有蚜蟲侵害，可用菊酯類農(nóng)藥噴打防治。
除蟲菊進入成齡苗期，木質(zhì)化不斷增強，自身抗蟲殺蟲菊酯日趨提高，同時揮發(fā)出一種異香氣味，含有濃厚菊酯成分，昆蟲類害蟲將會避而遠之。除蟲菊開花期揮發(fā)出菊香氣體，讓人聞著特別舒服，對蚊蠅驅(qū)避效果極佳。