犯罪違法所得的收益的處理措施是由公安機(jī)關(guān)妥善進(jìn)行保管。犯罪嫌疑人的違法所得認(rèn)定是看行為人是否通過法律禁止的手段獲得利益，對(duì)于違法所得的財(cái)產(chǎn)一般會(huì)作沒收處理。
一、犯罪違法所得的收益怎么處理
犯罪違法所得的收益由公安機(jī)關(guān)妥善保管，以供核查處理。
《公安機(jī)關(guān)辦理刑事案件程序規(guī)定》第二百三十條
對(duì)查封、扣押的財(cái)物及其孳息、文件，公安機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)妥善保管，以供核查。任何單位和個(gè)人不得使用、調(diào)換、損毀或者自行處理。對(duì)容易腐爛變質(zhì)及其他不易保管的財(cái)物，可以根據(jù)具體情況，經(jīng)縣級(jí)以上公安機(jī)關(guān)負(fù)責(zé)人批準(zhǔn)，在拍照或者錄像后委托有關(guān)部門變賣、拍賣，變賣、拍賣的價(jià)款暫予保存，待訴訟終結(jié)后一并處理。對(duì)違禁品，應(yīng)當(dāng)依照國家有關(guān)規(guī)定處理；對(duì)于需要作為證據(jù)使用的，應(yīng)當(dāng)在訴訟終結(jié)后處理。
二、犯罪嫌疑人違法所得怎么認(rèn)定
行為人通過法律禁止的手段獲取的即可認(rèn)定為違法所得。違法所得沒收由人民法院依法執(zhí)行。人民檢察院向人民法院提出沒收違法所得的申請(qǐng)，應(yīng)當(dāng)制作沒收違法所得申請(qǐng)書。對(duì)于沒收違法所得的申請(qǐng)，人民法院應(yīng)當(dāng)在三十日內(nèi)審查完畢。
《刑事訴訟法》第三百條
人民法院經(jīng)審理，對(duì)經(jīng)查證屬于違法所得及其他涉案財(cái)產(chǎn)，除依法返還被害人的以外，應(yīng)當(dāng)裁定予以沒收；對(duì)不屬于應(yīng)當(dāng)追繳的財(cái)產(chǎn)的，應(yīng)當(dāng)裁定駁回申請(qǐng)，解除查封、扣押、凍結(jié)措施。對(duì)于人民法院依照前款規(guī)定作出的裁定，犯罪嫌疑人、被告人的近親屬和其他利害關(guān)系人或者人民檢察院可以提出上訴、抗訴。
三、違法所得是否扣除成本
違法所得會(huì)扣除成本。對(duì)于“違法所得”認(rèn)定，一般情況采取經(jīng)營收入的“全部說”，因此成本與營利都會(huì)予以扣除。違法所得，是指行為人從事違反國家法律、法規(guī)規(guī)定的活動(dòng)，即實(shí)施了國家法律、法規(guī)禁止的行為，或未履行法定義務(wù)所獲得的利益。