工程分包合同常見的三種糾紛體現(xiàn)在總承包企業(yè)或專業(yè)施工企業(yè)與不具備相應資質的企業(yè)簽定的勞務分包合同、總承包企業(yè)或專業(yè)承包企業(yè)與勞務分包企業(yè)以勞務分包合同的名義簽訂的實質上的工程分包合同和工程分包企業(yè)以勞務分包合同的名義與勞務分包企業(yè)簽訂的實質上的工程再分包合同這三個方面。
1、總承包企業(yè)或專業(yè)施工企業(yè)與不具備相應資質的企業(yè)簽定的勞務分包合同。
這樣的合同，根據(jù)《最高人民法院若干審理建設工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋》第1條和《合同法》等規(guī)定被認定為無效合同。合同無效后的處理：如果勞務分包企業(yè)提供勞務的工程合格，勞務分包企業(yè)依據(jù)《最高人民法院關于審理建設工程施工合同糾紛案件的適用法律問題的解釋》第2條的規(guī)定，請求勞務費的應當?shù)玫椒芍С?。如果僅僅因勞務分包企業(yè)提供的勞務質量不合格引起的工程不合格，勞務分包企業(yè)請求勞務分包合同約定的勞務價款的，將得不到法律支持，并且，還應承擔相應的損失。
2、總承包企業(yè)或專業(yè)承包企業(yè)與勞務分包企業(yè)以勞務分包合同的名義簽訂的實質上的工程分包合同。
這種合同將依據(jù)合同的實際內容及建設施工中的客觀事實，及雙方結算的具體情況，來認定雙方合同關系的本質。其中有的可能會被認定為工程分包合同，那么就要按照工程分包合同的權利義務，來重新確認雙方的權利義務。
3、工程分包企業(yè)以勞務分包合同的名義與勞務分包企業(yè)簽訂的實質上的工程再分包合同。
這種合同將被認定為無效。工程分包企業(yè)因此種行為取得的利潤將被法院依據(jù)《最高人民法院關于審理建設工程施工合同糾紛案件的適用法律問題的解釋》第4條的規(guī)定收繳，或者由建筑行政管理機關作出同樣的收繳處罰。
相關知識介紹：
建設工程勞務分包企業(yè)的資質要求
建設部在《建筑業(yè)勞務分包企業(yè)資質標準》中對勞務作業(yè)分包的種類及各種類企業(yè)的資質標準作出了明確的規(guī)定。其中勞務作業(yè)分包包括13種，即：(1)木工作業(yè)(2)砌筑作業(yè)(3)抹灰作業(yè)(4)石制作(5)油漆作業(yè)(6)鋼筋作業(yè)(7)混凝土作業(yè)(8)腳主架作業(yè)(9)模板作業(yè)(10)焊接作業(yè)(11)水暖電安裝作業(yè)(12)鈑金作業(yè)(13)架線作業(yè)。每種作業(yè)的承包人都分別應具備相應的資質等級標準及作業(yè)的具體范圍。例如：一級木工企業(yè)作業(yè)可承擔各類工程的木工作業(yè)分包業(yè)務，但單項業(yè)務合同不得超過企業(yè)注冊資本金的5倍。
根據(jù)以上規(guī)定，建筑企業(yè)項目負責人在授權對外簽定勞務分包合同時，一定要嚴格審查：勞務分包企業(yè)的工商登記、注冊資本、經(jīng)營范圍、及企業(yè)勞務作業(yè)的資質等情況，以免簽定無效的勞務分包合同，產(chǎn)生不必要的勞務分包糾紛。