四個dna片段在山茶屬分子系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用

發(fā)布時間:2024-01-31
選取山茶屬14個組中的10組21種植物對目前常用于屬內(nèi)種間的4個dna片段(its、waxy、trnl-f、rpl16)進(jìn)行序列測定。結(jié)果表明:(1)來自葉綠體基因組的2個片段(trnl-f、rpl16)其pcr擴(kuò)增和測序都很容易,但兩者的進(jìn)化速率都非常慢,序列矩陣只有很少信息位點(diǎn)(trnl-f含9個,rpl16為20個),不能提供必要的系統(tǒng)發(fā)育信息。(2)來自核基因組的its片段其pcr產(chǎn)物比較容易獲得,但其序列的測定存在較多問題。(3)waxy是來自核基因組的另一個片段,其pcr擴(kuò)增因受模板dna的數(shù)量和質(zhì)量的影響很大而有一定難度,但其進(jìn)化速率較快,序列矩陣具有較多信息位點(diǎn)(92個),并且在山茶屬是單拷貝,這對于解決山茶屬這類具有許多近緣物種的類群的系統(tǒng)關(guān)系有重要價值?;趖snl-f、rpl16和waxy三組數(shù)據(jù)所建分子系統(tǒng)樹支持山茶屬為一單系,但屬下系統(tǒng)由于取樣等原因有待進(jìn)一步研究。完成機(jī)構(gòu):[1]中國科學(xué)院昆明植物研究所生物多樣性與生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,云南昆明650204 [2]中國科學(xué)院研究生院,北京100039
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