可以去工程所在地或被告所在地人民法院起訴，管轄法院應(yīng)該是區(qū)或者縣人民法院。
拖欠工程款屬于民事糾紛，清欠辦只負(fù)責(zé)農(nóng)民工工資，所以應(yīng)該在應(yīng)付工程款之日起兩年內(nèi)到法院起訴。憑借欠條可以直接起訴建設(shè)單位，但是應(yīng)當(dāng)盡可能提供施工合同，竣工結(jié)算文件。
起訴時盡量申請財產(chǎn)保全，查封被告名下賬戶，可以保障案件判決的順利執(zhí)行。
法律依據(jù)：《勞動合同法》第三十條
用人單位應(yīng)當(dāng)按照勞動合同約定和國家規(guī)定，向勞動者及時足額支付勞動報酬。用人單位拖欠或者未足額支付勞動報酬的，勞動者可以依法向當(dāng)?shù)厝嗣穹ㄔ荷暾堉Ц读睿嗣穹ㄔ簯?yīng)當(dāng)依法發(fā)出支付令。