菌核病是我國(guó)向日葵種植區(qū)發(fā)生最廣，為害最重的真菌病害。癥狀主要表現(xiàn)為兩種，一為立枯型，幼苗期為害莖基部，也叫根腐型；二是爛盤(pán)型，花期為害花盤(pán)，也叫爛頭型。病害無(wú)論發(fā)生在莖還是花盤(pán)上，都會(huì)造成褐色水浸狀軟腐，潮濕環(huán)境下會(huì)長(zhǎng)出白色絮狀菌絲，因此也稱白腐病。
莖部的腐爛會(huì)影響到養(yǎng)分運(yùn)輸，使葉片由下向上逐漸變黃、枯萎甚至脫落，最終使整個(gè)植株枯死或遇風(fēng)雨倒伏。花盤(pán)腐敗，使籽粒不能成熟，籽仁腐爛或籽爛自行脫落，受害種子變苦，品質(zhì)變壞，并影響發(fā)芽率。
病害發(fā)生后期，病菌的白色菌絲密集形成菌核，病菌就以土壤、病殘組織及種子中的菌核越冬，在土壤中一般可存活2～5年。第二年在向日葵出苗和幼苗期，菌核萌發(fā)，以菌絲侵染，形成立枯；菌核還可以長(zhǎng)出6~7厘米長(zhǎng)的子囊盤(pán)柄，將一種叫做子囊盤(pán)的繁殖器官送出地表，能產(chǎn)生子囊孢子，經(jīng)風(fēng)雨傳播，侵染花盤(pán)，造成花盤(pán)腐爛。通常，多雨年份，特別是七八月份連陰雨天氣，發(fā)病十分嚴(yán)重。排水不良的低洼地，種植過(guò)密，通風(fēng)透光不好和重茬或迎茬地塊發(fā)病率也較高。
防治向日葵菌核病首先要注意實(shí)行輪作倒茬和清除病殘?bào)w。提倡向日葵與小麥、玉米等禾本科作物輪作，避免與豆科、茄科連作。輪作年限至少3～5年。秋收時(shí)盡量清除秸稈，刨出根茬并深翻10厘米以上。
其次是化學(xué)防治。包括用2.5％適時(shí)樂(lè)種衣劑包衣處理，藥與種子的比例為1∶50或用50％多菌靈可濕性粉劑500倍液浸種4小時(shí)；防治立枯型可用速克靈可濕性粉劑每畝1公斤拌適量砂土，結(jié)合播種均勻撒入播種機(jī)開(kāi)溝內(nèi)；田間發(fā)病初期用速克靈或菌核凈對(duì)水逐株灌根防治，每穴2～3兩藥液，每隔7～10天灌防一次，至少兩次。防治爛盤(pán)可用40%紋枯利（菌核凈）800倍～1000倍液、乙烯菌核利或50%速克靈500~1000倍液、50%甲基硫菌靈（甲基托布津）1000倍液噴霧或多菌靈500倍液在盛花后間隔7天，連噴2~3次。
另外種植抗病品種、進(jìn)行覆膜種植、變等距為大小壟種植、調(diào)節(jié)播期、建設(shè)無(wú)病留種基地、實(shí)行統(tǒng)一供種也有一定的防治效果。