澳門港分外港和內(nèi)港。
外港位于澳門半島之東面，是為往來香港之定期客輪上落乘客所專用。內(nèi)港位于澳門半島西面，由34個碼頭組成，貨物之裝卸都在此運作，而內(nèi)港14號碼頭只供獲本局批準之船只上落乘客。
南舢舨碼頭位于內(nèi)港8號與9號碼頭之間，供錨泊于內(nèi)港之船舶上的人員登岸及離岸，且只限持有澳門居民身份證、葡藉認別證或獲有權(quán)限當局批準的人士才可在此登岸及離岸，并應事前向該處的水警稽查分站報備。往內(nèi)港航道及內(nèi)港航道均為55公尺寬，兩者之海圖深度都維持3.5 公尺。九澳港位于路環(huán)島之東北面，九澳港包括有油庫碼頭、水泥廠碼頭、集裝箱貨運站碼頭及發(fā)電廠碼頭，往九澳港之共同航道，寬為75公尺。
澳門在歷史上曾經(jīng)是遠東最繁榮的商埠之一，十六世紀后期到十七世紀前期的一百年間，是澳門的轉(zhuǎn)口貿(mào)易的全盛時期，澳門當時成為聯(lián)結(jié)歐洲、亞洲、拉丁美洲海上絲路貿(mào)易大循環(huán)的樞紐。然而鴉片戰(zhàn)爭以后，香港憑借著天然良港的優(yōu)勢，以及其他種種歷史和經(jīng)濟的原因，迅速取代澳門而成為遠東繁榮的貿(mào)易轉(zhuǎn)口港，而澳門因為自然條件的限制，港口泥沙淤塞嚴重，尤其是海上運輸從帆船時代進入輪船時代，航運更加不便，澳門的轉(zhuǎn)口貿(mào)易規(guī)模和范圍急劇縮小。
澳門回歸五年來，經(jīng)濟持續(xù)快速增長，多個大型基建項目相繼動工興建。美資、港資和澳門自己的大型酒店、娛樂場、會展中心等建設項目在澳門半島和氹仔島四處開花，澳門這個小城到處是一片繁忙的建設景象。另外，據(jù)澳門特區(qū)統(tǒng)計暨普查局最新資料顯示，今年第三季度，澳門零售業(yè)銷售總額為二十二億元，與去年同期相比上升了23%，與上一季度相比上升了4%。經(jīng)濟發(fā)展、銷費增加、大型建筑項目等，這些都使澳門的港口貨運量大幅提升，急劇增長的業(yè)務量讓這個只能停泊五千噸以下貨輪的港口空前繁忙。九澳港根據(jù)業(yè)務量大增的需要，興建一個新的貨輪泊位，于2005年12月破土動工。