當歸種子在室溫下放置1年即失去發(fā)芽率，在低溫干燥條件下可貯藏3年以上。成熟的種子在適宜的水分、溫度、氧氣等條件下，就可以發(fā)芽生長。種子萌發(fā)要經(jīng)歷三個過程：
（1）吸水膨脹過程構(gòu)成當歸種子的成分如淀粉、脂肪、蛋白質(zhì)及纖維素等均屬親水膠體，在干燥條件下呈凝膠狀態(tài)，而當種子吸水后，水分滲入種子內(nèi)部膠體網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)中，就使凝膠狀態(tài)變成溶膠狀態(tài)，體積隨之增大，這個過程屬于物理化學現(xiàn)象，叫做種子吸水膨脹過程。
（2）物質(zhì)轉(zhuǎn)化過程隨著種子吸水量的增加，各種酶的活性加強，呼吸活動也旺盛地進行，種子內(nèi)的復(fù)雜物質(zhì)（淀粉、蛋白質(zhì)、脂肪及纖維素等）在酶的作用下，水解轉(zhuǎn)化成可溶性的易被胚吸收的簡單物質(zhì)-——單糖、氨基酸等，這是種子萌發(fā)的能量、物質(zhì)來源。以上這些種子內(nèi)含物的變化，促進了胚的萌發(fā)，這些是生物化學現(xiàn)象，叫做種子物質(zhì)轉(zhuǎn)化過程。
（3）生物過程當種子吸水達本身重量45～50%左右時，吸水膨脹結(jié)束，加以種子內(nèi)含物的轉(zhuǎn)化，接著種子便開始萌動生長。首先是胚根開始伸長突破種皮，然后胚芽鞘也破皮而出，接著再長出一對或兩對種子根。在一般情況下，胚根比胚芽生長快，當胚芽達到種子長度一半，胚根與種子等長時，稱為發(fā)芽。
種子萌發(fā)后，胚根迅速伸長，并向下彎曲生長，進入土中，與此同時，胚軸伸長，使彎曲的子葉帶著果皮頂破表土，伸出地面。兩片長披針形的子葉展開，形成幼苗。子葉長到長約2厘米時，從子葉中央長出第一片初生葉。種子萌發(fā)和出苗，除了與種子質(zhì)量有關(guān)外，還與外界條件密切相關(guān)。
水分：種子發(fā)芽時內(nèi)部的一切生理變化必須有水分參加，但土壤水分過多，則氧氣不足，也不利于當歸發(fā)芽，甚至造成種子腐爛，即使出苗生長也很弱，所以當歸播種時，要求土壤含水量保持在22～28%。為使當歸種子發(fā)芽快，出苗齊，播種前一般進行浸種處理，使種子含水量達到40%左右。
溫度：當歸種子發(fā)芽的最低溫度為6℃，最適溫度20℃左右，最高溫度34～36℃。在一定范圍內(nèi)，種子萌發(fā)的速度隨溫度的增高而加快，但超過24℃以后，由于呼吸強度加大，萌發(fā)過程受到抑制；低于10℃時，發(fā)芽緩慢且不整齊，而且容易感染病害。一般在日平均氣溫16℃左右時有利于培育壯苗。正常播期條件下，從播種到出苗約需10～16天；日平均氣溫10～12℃播種，16～20天出苗；日平均氣溫20～24℃，播后7～14天出苗。
氧氣：當歸種子發(fā)芽時呼吸相當旺盛，需要充足的氧氣，土壤粘重，土壤濕度過大，板結(jié)，播種過深，種子因缺氧而不能萌動，甚至腐爛，即使出苗長勢也很弱。