為實(shí)驗(yàn)選擇合適的生物緩沖液(tris,mops,hepes,pipes等)可能很棘手,緩沖區(qū)選擇過(guò)程就像玩“猜猜誰(shuí)”。像游戲一樣,一般來(lái)說(shuō),可以從非常廣泛的緩沖區(qū)列表開(kāi)始,然后慢慢地提出問(wèn)題和研究答案以縮小選擇范圍。
在下文將給大家提供一些選擇生物緩沖液的注意事項(xiàng)。
確定實(shí)驗(yàn)的ph:
在許多實(shí)驗(yàn)中,需要更改條件以使蛋白質(zhì)在溶液中保持完?duì)顟B(tài)。舉個(gè)例子,假設(shè)在ph 7.4的條件下進(jìn)行了模擬生物條件的實(shí)驗(yàn),但是蛋白質(zhì)在此ph值下不穩(wěn)定,因此需要優(yōu)化這種情況。要注意的是,目標(biāo)ph值通常離蛋白質(zhì)等電點(diǎn)(pi)大約一個(gè)ph單位(有時(shí)稍遠(yuǎn))。pi是給定的分子或蛋白質(zhì)不帶凈電荷的ph值。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)達(dá)到其pi時(shí),它的溶解度就不那么高。
考慮不必要的緩沖區(qū)交互:
決定使用哪個(gè)緩沖區(qū)的另一個(gè)重要步驟是確定是否存在負(fù)緩沖區(qū)交互。舉個(gè)例子,如果正在使用一種酶,那么有機(jī)緩沖液可能會(huì)影響酶功能的好壞。
實(shí)驗(yàn)時(shí)需要考慮到的一些問(wèn)題:
就像游戲一樣,可以提出一些問(wèn)題,以確保獲得正確的緩沖。舉個(gè)例子,1.溶液中是否存在可能于緩沖液絡(luò)合的金屬?2.目標(biāo)蛋白是一種酶嗎?它屬于哪一類(lèi)?3.配體結(jié)合,蛋白質(zhì)穩(wěn)定性或電泳的離子強(qiáng)度要求是什么?像這樣的一些問(wèn)題根據(jù)實(shí)驗(yàn)時(shí)的具體情況來(lái)提問(wèn)并思考,將進(jìn)一步幫助找到合適的生物緩沖液(tris,mops,hepes等)
考慮下游實(shí)驗(yàn)時(shí)會(huì)有什么影響:
研究人員經(jīng)常遇到的一個(gè)絆腳石是,他們將從緩沖區(qū)開(kāi)始,并發(fā)現(xiàn)它不適用于下游應(yīng)用程序。舉個(gè)例子,已知tris會(huì)對(duì)bradford assay產(chǎn)生負(fù)面影響。其他生物緩沖液會(huì)對(duì)質(zhì)譜產(chǎn)生負(fù)面影響。不幸的是,在執(zhí)行第1步和第2步之后,可能已經(jīng)縮小了緩沖區(qū)的范圍,只是發(fā)現(xiàn)它在將來(lái)可能無(wú)法很好地工作。這就像“猜猜誰(shuí)”的噩夢(mèng)般的版本。在這種情況下,必須進(jìn)行一些研究以找到合適的替代方法。但是,既然已經(jīng)縮小了所需的特征,那么進(jìn)行這項(xiàng)研究就會(huì)容易一些。
尋找合適的緩沖區(qū):
當(dāng)知道要使用什么緩沖區(qū)時(shí),就應(yīng)該區(qū)采購(gòu)緩沖區(qū)了。對(duì)于大多數(shù)研究人員而言,*和純度基本上是在哪里購(gòu)買(mǎi)緩沖液的重要標(biāo)準(zhǔn)。當(dāng)然,也可以去找品牌的公司,那么將會(huì)獲得合適的產(chǎn)品。但是,其價(jià)格也一定不會(huì)便宜。取而代之,湖北新德晟材料有限公司具有不斷增長(zhǎng)的高質(zhì)量緩沖液產(chǎn)品,而且價(jià)格將會(huì)是您心里的*價(jià)位。
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