摘要:將 agilentinfinitylab poroshell hilic-z 色譜柱與 agilent6545 q-tof lc/ms 結(jié)合使用,對六天內(nèi)采集的哺乳動物細(xì)胞培養(yǎng)基中的養(yǎng)分吸收和分泌廢物進(jìn)行監(jiān)測。 hilic-z 色譜柱可保持良好的峰形與保留時間重現(xiàn)性,能適應(yīng)高鹽樣品(如細(xì)胞培養(yǎng)基)。該方法通過優(yōu)化流動相、梯度和儀器參數(shù),可用于在負(fù)離子模式下的單次分析運(yùn)行中對生長培養(yǎng)基的養(yǎng)分(即葡萄糖和氨基酸)與代謝廢物(即乳酸及 tca 循環(huán)相關(guān)的其他有機(jī)酸)進(jìn)行監(jiān)測。
前言:質(zhì)譜 (ms) 是一種高靈敏度分析技術(shù),常用于針對各種小分子的代謝組學(xué)研究1 。哺乳動物細(xì)胞代謝組學(xué)一躍成為在多個研究領(lǐng)域中具備應(yīng)用潛力的新興工具,研究細(xì)胞培養(yǎng)基中細(xì)胞消耗與分泌的多種代謝物變得越來越重要2,3。分析仍然面臨一些挑戰(zhàn),包括陰離子代謝物的保留4 、樣品基質(zhì)效應(yīng)5 ,以及螯合有機(jī)酸和磷酸化合物的分析性能6 。為應(yīng)對這些挑戰(zhàn),開發(fā)了一種穩(wěn)定且可重現(xiàn)的親水相互作用色譜 (hilic) lc/ms 方法,方法中采用 infinitylab 去活劑添加劑作為流動相改性劑,以增強(qiáng)金屬螯合有機(jī)酸和磷酸化分析物的峰形和檢測信號。作為色譜優(yōu)化與 hilic 色譜柱測試的一個步驟,對樣品基質(zhì)中鹽濃度的影響進(jìn)行了研究。研究中建立了一種分析細(xì)胞生長培養(yǎng)基中代謝物消耗和分泌的方法。
實驗部分:方法耐鹽性研究:為進(jìn)行 hilic lc/ms 方法開發(fā),選擇了一套涵蓋磷酸化分析物與磷酸糖異構(gòu)體的代謝物標(biāo)準(zhǔn)品。使用 milli-q 純化水配制 5 mg/ml 的分析物儲備液。然后用 80:20 的乙腈 (acn)/水將儲備液稀釋為 1 ng/µl (ppm) 的樣品。在實驗中,配制一份高鹽儲備液(4mol/l 尿素和 2mol/l 氯化鈉 (nacl) 水溶液)作為鹽加標(biāo)樣。將高鹽溶液按 20% (80 mmol/l 尿素、40 mmol/l nacl)與 40%(160 mmol/l 尿素、80 mmol/l nacl)加標(biāo)至代謝物標(biāo)準(zhǔn)品 (3 ng) 中。因為鹽不溶于樣品基質(zhì) (80% acn),因此沒有嘗試采用更高的鹽濃度 (> 40%)。細(xì)胞培養(yǎng)研究:在添加 10% 胎牛血清的 rpmi 1640 培養(yǎng)基中,培養(yǎng) k562 白血病細(xì)胞。立即(第 0 天)、24 小時(第 1 天)、48 小時(第 2 天)、72 小時(第 3 天)或 6 天(第 6 天)后采集部分細(xì)胞和培養(yǎng)基。將樣品在 250×g 條件下離心 5 分鐘,使細(xì)胞形成團(tuán)塊。將生長培養(yǎng)基 (100 µl) 轉(zhuǎn)移至另一個離心管,與 400 µl 50% acn 混合,再在 10000×g 條件下離心 5 分鐘。然后,對 1 µl 上清液進(jìn)行 hilic lc/ms 分析。使用 agilentmasshunter 定量分析軟件分析結(jié)果。
分析物分離:在 infinitylab poroshell 120 hilic-z, 2.1 mm × 50 mm, 2.7µm, peek 內(nèi)襯(部件號 679775-924)色譜柱上進(jìn)行色譜分離。首先配制一份 10 倍流動相緩沖儲備液(100 mmol/l 乙酸銨, ph 9.0)水溶液,然后用水(a 溶液)或 acn(b 溶液)配制 1 倍溶劑。在水溶液和有機(jī)流動相中添加 infinitylab 去活劑添加劑(部件號 5191-4506),確保濃度在梯度洗脫過程中保持不變。儀器使用 agilent1290 infinity 液相色譜儀與配備安捷倫噴射流離子源的 agilent6545 q-tof 的聯(lián)用系統(tǒng)進(jìn)行 lc/ms 分析。液相色譜儀包括: • 帶清洗密封墊的 agilent1290 infinity 二元泵 (g4220a) • 帶柱溫箱 (g1330b) 的 agilent 1290 infinity 自動進(jìn)樣器 (g4226a) • 安捷倫柱溫箱 (g1316c) 通過連續(xù)注入?yún)⒈荣|(zhì)量溶液,實現(xiàn)動態(tài)質(zhì)量軸校準(zhǔn)。表 1 和表 2 匯總了優(yōu)化的 lc 和 ms 條件。使用 agilentmasshunter 軟件套件進(jìn)行數(shù)據(jù)采集與分析。
結(jié)果與討論:利用 infinitylab poroshell hilic-z 色譜柱寬范圍的 ph 穩(wěn)定性與高分離度,開發(fā)了一種簡單而穩(wěn)定的 hilic lc/ms 方法。在本研究中,ph 9.0 的流動相在色譜分離中獲得了整總體結(jié)果。此外,添加 infinitylab 去活劑添加劑明顯改善了鰲合有機(jī)酸與磷酸化合物的峰形,同時增強(qiáng)了信號強(qiáng)度。在 dmem 與 rpmi 1640 這兩種常用的培養(yǎng)基中,含有的高濃度無機(jī)鹽包括(nacl,約 100 mmol/l)、(kcl,約 5 mmol/l)和硝酸鈣(ca(no3)2,約 0.4 mmol/l)。這些無機(jī)鹽可保持培養(yǎng)基滲透平衡,并有助于調(diào)節(jié)培養(yǎng)細(xì)胞的膜電位。為確定鹽對保留時間重現(xiàn)性與代謝物峰形的影響,我們使用 hilic lc/ms 方法對濃度增加的尿素和 nacl 加標(biāo)樣品進(jìn)行分析(圖 1)。結(jié)果表明,hilic 色譜柱保持了保留時間重現(xiàn)性,同時高鹽樣品中的目標(biāo)核苷酸(如 amp、adp、atp 和 gtp)與磷酸糖異構(gòu)體(如葡萄糖-1-磷酸鹽和葡萄糖-6-磷酸鹽)檢測到極小的離子抑制(圖 1)。
接下來,我們設(shè)計了一項實驗,用于監(jiān)測細(xì)胞培養(yǎng)基在六天時間內(nèi)的養(yǎng)分消耗與代謝物分泌(圖 2)。在生長培養(yǎng)基中,乳酸作為代謝廢物,隨時間推移而逐漸積累(圖 3,第 1 列)。此外,在監(jiān)測過程中,有關(guān) tca 循環(huán)的其他有機(jī)酸(即蘋果酸、α-酮戊二酸 (α-kg)、*和檸檬酸)在生長培養(yǎng)基中分泌并逐漸累積(圖 3)。相比之下,細(xì)胞在代謝過程中消耗了糖,因此葡萄糖濃度隨時間推移逐漸降低(圖 3,第 2 列),直至*耗盡(圖 3,第 2 列,第 6 天)。氨基酸濃度也隨時間推移而逐漸降低,這是因為細(xì)胞消耗了生長培養(yǎng)基中的養(yǎng)分(圖 4)。結(jié)果表明,在單次 hilic lc/ms 運(yùn)行中,可對哺乳動物細(xì)胞培養(yǎng)基中包括有機(jī)酸與氨基酸在內(nèi)的各種代謝物進(jìn)行分析和監(jiān)測。