茶樹(shù)簡(jiǎn)化ecotilling技術(shù)的建立

發(fā)布時(shí)間:2024-07-05
ecotilling (ecotype targeting induced local lesions in genomes)可快速檢測(cè)自然群體中的snp(single nucleotide polymorphism)等dna變異。第一次建立了簡(jiǎn)化的茶樹(shù)ecotilling技術(shù)體系:首先篩選擴(kuò)增目的基因的特異pcr引物;然后通過(guò)celi酶切pcr產(chǎn)物優(yōu)化實(shí)驗(yàn),確定酶切時(shí)間20min、10×buffer組成為250mmol/l tris-hci(ph7.4)、150mmol/lkci、15mmol/lmgso4、4lag/mlbsa和0.04%triton x-100,反應(yīng)溫度為47.5℃,酶量為1.8μl cje(celery juice extract)/10μl反應(yīng)體系時(shí),酶切的譜帶信號(hào)較強(qiáng)、特異性高;初步確定合適的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)條件為凝膠濃度5%、上樣量4~5μl、有效分離長(zhǎng)度要達(dá)到15cm。利用上述簡(jiǎn)化的ecotilling對(duì)6份茶樹(shù)種質(zhì)870bp的ppo基因片段實(shí)現(xiàn)了分型,經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證酶切產(chǎn)生的譜帶與6份種質(zhì)內(nèi)部或不同種質(zhì)間的snp位置吻合。完成機(jī)構(gòu):中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所茶樹(shù)資源與改良研究中心/國(guó)家茶樹(shù)改良中心,浙江杭州310008
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